流式细胞仪能否辨别到种是一些藻类检测工作者最关心的问题之一。而成像质量的提高，可帮助我们观测到鉴定相关的细节和高清晰度的内部小结构。
理论上，放大倍数越高，成像质量越好，如40X或60X。 然而缺点是倍率越高景深越小，因此一些成像倍率高的设备通常采用非常窄的流动池，也就意味着你只能分析非常小的颗粒，因此，野外样品（如自然海水等）需要将所有大粒径的颗粒过滤掉。CytoBuoy经过不懈努力，更新光学元件，实现在16X放大倍数下使用非常大的流动池呈现高质量的图像。新系统可设置仅在颗粒穿过相机焦平面时进行拍摄，这意味着不再有模糊照片形成的照片流阻碍。
关于CytoSense当前使用的超大流通池和放大倍数，CytoBuoy 公司CEO George B.J. Dubelaar 先生给了比较详细的介绍：
样品的过滤预处理
为防止流式细胞仪管路堵塞，大部分流式细胞仪都会标明客户在分析样品之前需要对样品进行过滤预处理。而我们使用的滤膜过滤孔径与实际通过的颗粒粒径并非完全一致。实际上，如果你使用过滤孔径为Xμm 的滤筛过滤样品，一般来说自由通过的颗粒粒径只有X的1/3。粒径大于1/3Xμm 的颗粒会随着过滤时间的增长越来越难自由通过滤筛。因此，通过的颗粒数量偏低且对浓度的评估不准确，因为接近Xμm大小的颗粒几乎没有通过。所以，使用非常粗略的方法可以推测，在仪器入口前对任何颗粒使用Xμm孔径的筛网进行过滤，所得最大颗粒粒度的正确测定值仅为X的一半。假如设备要求样品分析前必须经过70μm 网筛过滤，这可能意味着其最佳分析粒径为30-40μm。对于CytoSense, 我们建议采用1mm甚或1.2mm滤膜过滤以防堵塞。
图像清晰度的关键还取决于光学透镜的设计
我们通常认为成像质量依赖于透镜的放大倍数。有些成像流式细胞仪只有在40X和60X放大倍率下才能获得好的照片，这种倍率下景深极窄和画框尺寸非常小。对与野外样品就会存在粒径限制——最大照片画框尺寸的20X倍率也只能分析120μm。CytoSense 具有16X 放大倍数，然而我们最新透镜（专门为我们流式细胞仪定制设计）的光学设计非常优秀，而且事实上聚焦的图像的清晰度比我们的其他同类产品的20X放大倍率还要好。更重要的是，我们可以对所有大到直径500um的颗粒进行高质量成像。
分享一组测试照片，感受一下新版CytoSense实际的成像效果。结合散点图，Silico-imaging详细记录细胞的全部光学信息，逐个扫描，不放过自然水体中的稀有藻种。
| 空星藻（Coelastrum.） |  |
| 小环藻（Cyclotella sp.） |  |
| 小环藻（Cyclotella sp.） |  |
| 小环藻（Cyclotella sp.） |  |
| 直链藻（Melosira） |  |
| 颗粒直链藻极狭变种（Melosira granulata var angustissima） |  |
| 角甲藻（Ceratium） |  |
| 鱼磷藻（Mallomonas） |  |
| 根管藻（Rhizosolenia） |  |
| 等片藻Diatoma |  |
| 啮蚀隐藻Cryptomons erosa |  |
| 浮游动物 |  |